高新專項審計是指注冊會計師接受擬向有關部門，請求進行高新技術企業確定的申報企業托付。對申請部門近三個會計年度（實踐運營不滿三年的按實踐運營年限）的研討開發費用結構明細表和近一個會計年度的高新技術產品（服務）收入明細表進行審計，并出具專項審計報告。

　　假如該公司近三個會計年度的財務報表（含資產負債表、損益表、現金流量表，實踐年限缺乏三年的按實踐運營年限）未經會計師事務所審計，應一起托付進行財務報表審計。此外有以下情況的，都需求進行高新專項審計：

　　①凡是準備申請高新認定的額企業，都需要進行高新專項審計。

　　②由于高新確定審計企業資格自頒布證書之日起限定期是三年，在三個月內企業應提出復審請求。

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