高新專項審計跟一般的審計流程差不多，但實質性程序的側重點略有不同，詳細情況如下：

　　一、審計前預備

　　1.認真學習最新版的《高新技能企業承認管理辦法》、《高新技能企業承認管理作業指引》、《高新技能企業承認專項審計指引》等輔導文件，掌握學習高新技能企業承認的文件、程序等；學習《國家重點支撐的高新技能范疇》，了解國家重點支撐的高新技能范疇詳細有哪些；

　　2.依據審計需求，要求被審計單位供給材料。

　　二、高新專項審計程序

　　1.高新技能產品（服務）收入的定義：高新技能產品（服務）收入是指企業經過技能創新、開展研制活動，形成契合《重點范疇》要求的產品（服務）收入和技能性收入的總和。

　　技能性收入首要包含以下幾個部分：

　　（1）技能轉讓收入：指企業技能創新效果經過技能貿易、技能轉讓所獲得的收入；

　　（2）技能承包收入：包含技能項目規劃、技能工程施行所獲得的收入；

　　（3）技能服務收入：指企業利用自己的人力、物力和數據系統等為社會和本企業外的用戶供給技能方案、數據處理、測驗剖析及其他類型的服務所獲得的收入；

　　（4）承受托付科研收入：指企業承擔社會各方面托付研討開發、中心實驗及新產品開發所獲得的收入。

　　2.高新技能產品（服務）收入審計重視關鍵

　　（1）審計人員應了解企業管理當局差異高新技能產品（服務）的承認標識，以便規劃相關程序測驗高新技能產品（服務）的承認標識，承認申報企業是否混淆高新技能產品（服務）收入與非高新技能產品（服務）收入的邊界，是否虛增高新技能產品（服務）收入；

　　（2）審計人員應搜集申報企業知識產權證書（包含創造、實用新型、外觀規劃等的專利證書，軟件著作權證書）或獨占許可合同、出產批文、新產品或新技能證明、產品質量檢驗陳述、省級以上科技方案立項證明以及其他相關證明材料，驗證企業管理當局差異高新技能產品（服務）承認標識。

　　（3）一般產品與高新技能產品組合出售獲得的出售收入，高新技能產品（服務）收入明細表中按全額承認為高新技能產品（服務）收入。收入明細表中對一般產品收入部分是否應該除掉？假如需求除掉，又該如何除掉一般產品的出售。審計人員關于上述情況應差異處理。

　　（一）假如一般產品與高新技能產品互相能夠獨立出售，應獲得申報企業的產品（服務）價格目錄，按一般產品與高新技能產品出售價格從頭核算后對高新技能產品（服務）收入予以調整，將一般產品收入從高新技能產品（服務）收入中扣除，收入明細表按凈額列報；

　　（二）假如無法對組合出售的一般產品與高新技能產品進行差異或一般產品僅是高新技能產品的附件，則無需調整收入明細表，但就上述事項應在高新專項審計陳述中進行闡明和發表。

　　（4）外購與本企業相同的高新技能產品出售，其出售收入是否可以在高新技能產品（服務）收入明細表中列報。審計人員應注意外購與本企業相同的高新技能產品出售收入不該列報在高新技能產品（服務）收入明細表中作為本企業高新技能產品（服務）收入。

　　（5）《企業會計準則第14號一收入》是指企業在日常活動中形成的、會導致一切者權益添加的、與一切者投入資本無關的經濟利益的總流入，包含出售商品收入、供給勞務收入和讓渡財物運用權收入等。《管理辦法》對總收入概念沒有做出詳細定義，從字面理解應該比準則收入概念要寬泛些，應該還包含非日常活動中獲得的收入。申報企業若在申報當年產生了嚴重的債務重組、嚴重的非貨幣性財物買賣或許獲得巨額政府補助等非日常活動收入，履行新會計準則的企業在核算方針時就顯得比較吃虧。因為總收入中包含了債務重組、非貨幣性買賣等非日常活動產生的收入，在核算高新技能產品（服務）收入占企業當年總收入的比例時簡單導致企業因非日常經濟事件而導致高新技能產品（服務）收入方針無法達到60%

　　以上，審計人員應加以重視。

　　三、研討開發費用專項審計

　　1.定義

　　研制活動是指為獲得科學與技能（不包含人文、社會科學）新知識，創造性運用科學技能新知識，或實質性改進技能、產品（服務）而持續進行的具有清晰方針的活動。

　　研制項目是指“不重復的，具有獨立時刻、財政組織和人員配備的研討開發活動”。企業的研討開發費用是以各個研制項目為基本單位別離進行測度并加總核算的。

　　研討開發費用內容包含：人員人工、直接投入、折舊費用和長時間費用攤銷、規劃費、配備調試費、無形財物攤銷、托付外部研討開發費用、其他費用等。

　　2.高新技能企業承認專項審計研討開發費用規模、歸集、分攤辦法及審閱關鍵

　　（1）人員人工

　　（一）規模：從事研討開發活動人員（也稱研制人員）全年薪酬薪水，包含基本薪酬、獎金、補貼、補貼、年終加薪、加班薪酬以及與其任職或許受雇有關的其他開銷。.

　　（二）歸集和分攤辦法：對企業存在多個研制項目的，還要按實際參與的項目進行歸集，若研制，人員同時參與兩個或兩個以上項目應按統計的作業量進行分攤，無作業量統計的，則選擇當期各項目直接投入占總投入比例進行分攤。

　　（三）主張：企業應當設有專門的科研人員名冊，一方面便于申請承認時科研人員比例要求的核對；另一方面，便于在費用歸集時的相互對應。

　　（四）企業應當和科研人員簽訂勞動合同，繳納社會保險，著重的是科技人員在企業作業時刻每年不少于半年（183天）。在付出科研人員人工費時，可以考慮集中制表且與勞動合同相一致。

　　（五）審閱關鍵：查看應付薪酬、應付福利費、管理費用明細賬，全年各月份薪酬表、個人所得稅申報表，勞動合同、參與社會保險材料；結合研制部門人員名單，承認研制人員的薪酬是否真實，核算是否準確。獲取受雇的科研人員累計實際作業時刻在183天以上的依據。

　　（2）直接投入

　　（一）規模：企業為施行研制項目而購買的原材料等相關開銷。如：水和燃料（包含煤氣和電）運用費等；用于中心實驗和產品試制達不到固定財物標準的模具、樣品、樣機及一般測驗手法購置費、試制產品的檢驗費等；用于研討開發活動的儀器設備的簡單保護費；以經營租賃方式租入的固定開銷產生的租賃費等。

　　（二）歸集和分攤辦法：一般為直接計入，對動力費用、一起運用的模具、樣品、樣機、及一般測驗手法購置費等按各研制項目運用的作業量等可行辦法核算后計入。

　　（三）審閱關鍵：查看管理費用、原材料明細賬、原材料購入、發出、總存明細表、相關費用分配表等，承認其結轉研制費用的合理性及金額的準確性。

　　（四）關于直接購入的能源、材料則查看購入的發票、運輸單據、入庫單、領料單等，承認其真實性及與研制項目的相關性。

　　（3）折舊費用與長時間待攤費用

　　（一）規模：包含為履行研討開發活動而購置的儀器和設備以及研討開發項目在用建筑物的折舊費用，包含研制設備改建、改裝、裝飾和修理過程中產生的長時間待攤費用。

　　（二）歸集和分攤辦法：歸于多個項目運用的，按各研制項目運用作業量等可行辦法核算后計入。

　　（三）審閱關鍵：查看固定財物明細賬、長時間待攤費用明細賬，查看被審計單位年度新增固定財物及長時間待攤費用的發票、固定財物的申購單、入庫單、驗收單。實地查看該部分設備，承認其是否真實存在，是否用于研制。復核各項折舊、攤銷的準確性。對購入時已計入研制費用的是否重復計提折舊。

　　（4）規劃費用

　　規模：規劃費用是為新產品和新工藝的構思、開發和制造，進行工序、技能規范、操作特性方面的規劃等產生的費用。

　　（5）配備調試費

　　（一）規模：配備調試費首要包含工裝預備過程中研討開發活動所產生的費用（如研制出產機器、模具和東西，改變出產和質量控制程序，或擬定新辦法及標準等）。為大規模批量化和商業化出產所進行的慣例性工裝預備和工業工程產生的費用不能計入。

　　（二）歸集辦法：上述兩項一般不會有一起費用，可直接計入。

　　主張：規劃費用、配備調試費，要有合法依據，這些費用往往是產生在企業內部中，沒有多少外來原始憑據，過后很難搜集和核實。比方調試設備的次數和每次耗費電費、相關技能工人的人工。企業應按內部核算的要求，加強基礎核算作業，財政部門與科研部門和諧合作，做好原始記錄和憑據，及時履行批閱程序，逐月結算入賬。

　　（三）審閱關鍵：規劃費審閱關鍵：查看管理費用明細賬——研制費用明細科目，查看規劃費用開銷的發票，付款申請批閱單據，承認其費用產生的真實性及金額的準確性。托付外部規劃費用需查看合同、協議等。

　　配備調試費審閱關鍵：為大規模批量化和商業化出產所進行的慣例性工裝設備和工業工程產生的費用不能計入。

　　（6）無形財物攤銷

　　（一）規模：因研討開發活動需求購入的專有技能（包含專利、非專利創造、許可證、專有技能、規劃和核算辦法等）所產生的費用攤銷。

　　（二）歸集和分攤辦法：歸于作業量等可行辦法核算后攤銷計入。

　　（三）審閱關鍵：查看無形財物明細賬、管理費用明細賬，查看無形財物購入發票、付款憑據、專有技能證書等材料，承認其真實性及攤銷金額的準確性。

　　（7）托付外部研討開發費用

　　（一）規模：托付外部研討開發費用是指企業托付境內其他企業、大學、研討機構、轉制院所、技能專業服務機構和境外機構進行研討開發活動所產生的費用（項目效果為企業擁有，且與企業的首要經營事務嚴密相關）。

　　（二）歸集辦法：一般不會有一起費用，可直接計入。

　　主張：托付外部研制費用要注意項目效果及與企業首要事務嚴密相關是衡量外部研制費用能否計入的重要因素。在簽訂托付合同時，應當特別注明。承認過程中，產生的悉數托付外部研制費用，按照產生額的80%計入研制費用總額。而該規則，在核算加計扣除時則沒有這樣的限制。

　　（三）審閱關鍵：查看管理費用明細賬、與托付外部研制費用相關的明細賬，托付外部研制費用的合同或協議，查看發票、付款憑據，承認其產生的真實性及金額核算的準確性，是否是相關買賣。

　　（8）其他費用

　　（一）規模：為研討開發活動所產生的其他費用，如辦公費、通訊費、專利申請保護費、高新科技研制保險費等。此項費用一般不得超過研討開發總費用的10%，另有規則的除外。

　　（二）歸集和分攤辦法。單個項目產生的直接計入；歸于多個項目，按各個項目直接投入占總投入比例分攤；若費用較小則可直接計入某項目。

　　（三）審閱關鍵：查看管理費用明細賬，費用分攤表，承認費用開銷與研討項目的相關性及費用分攤的合理性。重視其他費用金額一般不得高于研制費用總額的10%。

　　四、高新專項審計陳述

　　1.完結審計作業

　　在施行了上述一切審計程序后，注冊會計師應當匯總審計測驗的結果，進行更具綜合性的審計作業，如編制審計差異調整表和試算平衡表，履行剖析程序，編撰審計總結以及完結審計作業草稿的復核等。在此基礎上，注冊會計師應當點評審計結果，在與申報企業管理層和治理層交流后，承認應出具專項審計陳述的意見類型和遣詞，從而編制并致送專項審計陳述，完結審計作業。

　　2.出具專項審計陳述的特別考慮.

　　（1）專項審計陳述不該后附整套財政報表

　　依據《我國注冊會計師審計準則第1601號——對特別目的審計事務出具審計陳述》的規則，為避免信息運用者誤認為對財政報表組成部分出具的審計陳述與整套財政報表相關，注冊會計師不該將整套財政報表附于專項審計陳述后。

　　（2）對年度財政報表審計陳述的特別考慮

　　（一）注冊會計師應當考慮在施行年度財政報表審計時與研討開發費用結構明細表[高新技能產品（服務）收入明細表]審計有關的審計結論，重視年度財政報表審計陳述的類型，是否存在與申報企業研討開發費用、高新技能產品（服務）收入相關的非標準審計陳述的情況，并考慮其對本高新專項審計事務及審計意見的影響。

　　（二）假如已對整套財政報表出具否定意見或無法表示意見的審計陳述，只有在企業年度研討開發費用和高新技能產品（服務）收入并不構成財政報表的首要部分時，注冊會計師才可以對其出具專項審計陳述。否則，會對整套財政報表的審計陳述產生影響。